A diferença entre um pokémon de evento e um pokémon normal é o modo como se consegue. Como o próprio nome já diz, um pokémon de evento é de evento (dedução brilhante, não?)
Esse código a mais, todo pokémon tem independente de ser de evento, capturado no matinho, na caverna, feito de ovo, ou obtido por presente (como o seu starter). E vou mais longe. Não é um código, e sim dois códigos. O primeiro código determina os IVs (Individual Values) de cada pokémon. Este código é gerado no momento em que você inicia o jogo ou no momento em que você liga a C-Guear e se altera dependendo das sua ações no jogo, como por exemplo andar. Este código muda a cada 128 passos, dentre outras coisas. O segundo código, normalmente chamado PID (pokémon ID), determina a nature, ability, se o pokémon é macho ou fêmea ou se é shiny e também se altera dependendo das suas ações no jogo.
Além do código do pokémon, tem o ID do treinador, um número de 5 dígitos que pode ser conferido no trainer card. É por este número que o jogo sabe se um pokémon foi você que capturou ou se é de outro treinador (e neste caso, ele desobedece mais fácil se você não tiver badges e também ganha mais exp). Além destes 5 números visíveis no jogo, há mais número de 5 dígitos ocultos, conhecidos como SID (Secret ID, que foi chamado Hidden ID pelo dono do tópico). Estes dois números em conjunto determinam o dono do pokémon (quem capturou) e estão nas informações do pokémon (o SID não pode ser visto, mas está lá).
No caso de pokémons de evento, a maioria pertence a um "treinador" de evento e por isso carrega o ID e o SID desse tal treinador, mas isto varia de evento para evento. Neste caso, os pokémons de um mesmo evento tem o mesmo ID e SID, mas não necessariamente o mesmo PID. Alguns eventos já deixam algumas características dos pokémons pre-determinadas, como por exemplo uma nature (o Heatran do Pokémon Ranger 3, que tem eruption sempre é Quiet, por exemplo). A maioria é "capturado" em "A fateful encounter". Mas isto pode variar de evento para evento.
E é por isso que eu digo, a diferença de um pokémon de evento para um pokémon normal é que um pokémon de evento é de evento. Se houver alguma diferença no cógido, elas não interferem em características como ID, ou PID. No máximo tem uma trava para não trocar pelo GTS ou alguma coisa que ativa um evento in game (Celebi por exemplo que ativa o Zorua), mas características, digamos, importantes são as mesmas.
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Manda MP pra add.
Esqueci de transferir meu Ditto 6IV do White 2 enquanto o Pokémon Bank estava de graça -.-