Bem, eu só queria saber como você vai obter Pokémons de troca pelo emulador, mas como você os colocou como já escolhidos, imagino que você já tenha resolvido isso, então vamos direto ao assunto...
Eu tentarei evitar TM's e Egg Moves nos Movesets, mas ainda vão estar lá, por que as vezes eles são muito importantes nos Movesets de alguns Pokémons.
Se você escolher Chikorita...- Meganium (Quiet): Body Slam, Petal Dance, SafeGuard, Synthesis/PoisonPowder.
- Ampharos (Modest): Thunderbolt/Discharge, Signal Beam, Power Gem, Charge.
- Crobat (Adamant): Confuse Ray, Poison Fang, Mean Look, Wing Attack.
- Arcanine (Nature Neutra): Flamethrower, Thunder Fang, ExtremeSpeed, Take Down/Reversal.
- Lapras (Quiet): Surf, Ice Beam, Confuse Ray, Body Slam.
- Miltank (Adamant): Milk Drink, Body Slam, Heal Bell, Rollout.
Se você escolher Cyndaquil...- Thyphosion (Modest): Flamethrower/Lava Plume, Swift, Sunny Day**, SolarBeam.
- Ampharos (Modest): Thunderbolt/Discharge, Signal Beam, Power Gem, Charge.
- Crobat (Adamant): Confuse Ray, Poison Fang, Mean Look, Wing Attack.
- Vileplume (Modest): Sludge Bomb*, Moonlight, Sunny Day**, SolarBeam.
- Lapras (Quiet): Surf, Ice Beam, Confuse Ray, Body Slam.
- Miltank (Adamant): Milk Drink, Body Slam, Heal Bell, Rollout.
*Há como comprar o TM na Battle Frontier, mas você também o recebe na Rota 43 do jogo. =D
** Para o Typlosion você utiliza o TM, agora para o Vileplume você tem que conseguir o Egg Move do Sunkern, que aprende Sunny Day no Lv37. É um pouco difícil, mas vale a pena, já que vai beneficiar o Moonlight e o SolarBeam.
Se você escolher Totodile...- Feraligatr (Adamant): Aqua Tail, Crunch, Ice Fang, Slash.
- Ampharos (Modest): Thunderbolt/Discharge, Signal Beam, Power Gem, Charge.
- Crobat (Adamant): Confuse Ray, Poison Fang, Mean Look, Wing Attack.
- Arcanine (Nature Neutra): Flamethrower, Thunder Fang, ExtremeSpeed, Take Down/Reversal.
- Vileplume (Modest): Sludge Bomb*, Moonlight, Sunny Day**, SolarBeam.
- Miltank (Adamant): Milk Drink, Body Slam, Heal Bell, Rollout.
É isso, então! Só um último detalhe... Você deve estar se perguntando por que eu coloquei uma Miltank no meio de todas as equipes, mas sério, cara, vai ser útil. Além de poder ficar se recuperando e ter bons stats em Defesa e Velocidade, consegue causar um estrago enorme no time do adversário, e ainda é Cleric Healer. Mas, caso você não esteja gostando de algum Pokémon do time base, é só tentar um substituto que não deve ser muito complicado. Enfim, espero ter ajudado!
P.S.: Eu sei que você estava querendo utilizar o Magmar como tipo Fogo, mas o Arcanine tem a vantagem de poder evoluir mais facilmente de Growlithe, por isso eu achei melhor e desconsiderei. E, eu sei que eu já mencionei isso, mas como você pretende obter os Pokémons de trocas no emulador? Sério, eu não sei se existe algum método, mas se tiver, há um bom moveset para o Gengar que você pretendia utilizar e um Scizor que poderia cair bem:
- Gengar (Modest): Mean Look, Curse, Shadow Ball, Rest/Psychic.
- Scizor (Adamant): X-Scizor, Slash, Agility, Night Slash/Iron Head.
Se for utilizar o Gengar, tire o Vileplume da equipe (se for começar com a Chikorita, o menos útil para se trocar pelo Gengar é o Ampharos). Se for utilizar o Scizor, tire a Miltank. Se for utilizar os dois, substitua os dois por outros de mesma Nature, preferencialmente Ampharos/Vileplume e Miltank.