Bom, particularmente dos que eu joguei os mais legais foram o The Legend of Zelda: Ocarina of Time 3D, Kid Icarus: Uprising, Fire Emblem Awakening, Scribblenauts, Harvest Moon: A New Beggining e New Super Mario Bros. 2.
Zelda é Zelda, então acho que nem preciso explicar muito. O remake ficou muito bem feito, eu curti muito.
Kid Icarus dá pra dizer que é um jogo de tiro em terceira pessoa onde você luta tanto no ar quanto na terra. Além do modo história ser bem legal e tudo ainda tem um online bem legal pra quando zerar.
Fire Emblem Awakening é um RPG Tático medieval, uma mistura de xadrez com RPG, que é bem divertido. Eu viciei nesse jogo, zerei 4 vezes, é muito bom e a dificuldade é bem seletiva, desde algo bem simples até um jogo impossível de se passar da primeira fase.
Scribblenauts é um jogo que talvez você já tenha ouvido falar. Basicamente é um jogo "simples" de puzzle aonde te dão problemas para você resolver com seu caderno mágico que faz qualquer coisa escrita nele aparecer. Existem várias versões, particularmente eu acho as de PC melhores, mas as de 3DS são boas também. É um jogo um pouco curto entretanto.
Harvest Moon: A New Beggining é um jogo de fazendinha, mas tem um gameplay bem amplo. É tanta coisa pra fazer e tanta coisa nova que você aprende conforme o jogo se passa que parece que nunca vai ter fim. É bem divertido, mas precisa de um pouco de paciência no começo.
New Super Mario Bros 2, bom... É Mario. É um Mario bem simples e divertido, pra você jogar quando estiver realmente querendo se divertir e tudo mais. É bem simples e relativamente curto, mas é difícil de enjoar.
Agora dos que eu não joguei ainda, eu recomendaria o Super Mario 3D Land e Mario Kart 7. Acho que esses dois não preciso falar o porque.
Alguns que talvez não sejam do agrado de todo mundo, eu recomendo Professor Layton, Rune Factory 4 e Tomodachi Life.
Professor Layton é quase um livro de mistério em forma de jogo, focado totalmente em ficar resolvendo puzzles. A maioria deles são bem simples, pensando um pouco ou nem tanto você já consegue resolver, então é bem divertido.
Rune Factory 4 é uma espécie de Harvest Moon só que com conceitos de RPG. No caso, você pode usar armas, skills e upar seu personagem matando monstros pelos campos.
Tomodachi Life é um jogo um tanto quanto diferente, basicamente você cria Miis (aqueles bonecos da Nintendo) em uma ilha com base no que você quiser e você meio que vira um deus do lugar. Você controla o que eles vão vestir, como vai ser a casa deles, quem eles vão ser amigos e etc... Cria várias situações bem randômicas, é algo que você joga de tempo em tempo sem compromisso já que o gameplay é bem livre.