Sobre o bendito Ho-oh em Colosseum

Acabei de zerar Pokémon Colosseum. Tenho os 48 shadows capturados e purificados. E agora quero ir para a ultima meta: Obter meu Ho-oh.
Segundo o detonado da PM, eu devo fazer 100 batalhas no Mt. Battle e ele aparecerá num slot do PC. Mas pelo o que eu andei vendo na internet, precisa ser com a equipe do Story Mode, e se eu batalhar com a do GBA eu não vou receber. E ai vem um porém.

Minha equipe toda de Colosseum foi "criada" (E não transferida) com base nos meus Pokémon de Sapphire. Se eu entrar no Mt. Battle com ela eu receberei meu Ho-oh no final? Quando eu li "Pokémon do Story Mode" significa qualquer Pokémon de lá (Mesmo sendo trocado) ou apenas os 50 que eu posso obter lá dentro? Como o game sabe que eu estou com os Pokémon do Story Mode? Pelo ID, OT, SID? Ou eles fazem uma verificação da team quando eu termino de capturar o Entei?

Qualquer ajuda é bem vinda.